Baltasar de Zúñiga y su ayudante Juan lobo acaban de llegar a la costa española para informar al rey de la catástrofe que había sufrido la armada invencible creada por Felipe II para invadir Inglaterra.

Mientras va a informar al rey, Baltasar tiene una misión para Juan: acompañar para su protección a dos inquisidores que van investigar unas desapariciones muy extrañas en un pequeño pueblo de Toledo.

Cuando los frailes acompañados de Juan Lobo llegan a Casarrubios del monte, que así se llama el pueblo, se encuentran con un clima de inquietud y miedo, cuyas razones empiezan investigar.

Cada vez se van complicándo más sus indagaciones, que abordan desde prismas diferentes: por un lado el fanatismo religioso de fray Gonzalo, y por el otro el amor por el conocimiento y el razonamiento de fray Bernardo.